宇宙科学運営協議委員は21名以内で組織され、半数程度は宇宙科学研究所に所属する教育職職員から、残りの者については研究所の目的たる研究と同一の研究に従事する大学の教員その他の者のうちから、それぞれ所長の推薦を基にJAXA理事長が任命します。宇宙科学運営協議会は、以下の目的をもちます。

1. 宇宙科学研究所に所属する教育職職員の候補者を選考し、所長に推薦すること
2. 大学との共同その他の方法による宇宙科学に関する学術研究及びこれに関連する業務に関する重要事項について、所長の諮問に応えること。
3. 宇宙科学評議会の求めに応じ、所長の候補者に関し意見を述べること。

第12期名簿 （50音順）

生駒　大洋	国立天文台教授
大竹　真紀子	会津大学コンピュータ理工学部教授
木村　真一	東京理科大学スペースシステム創造研究センター長
鈴木　志野	理化学研究所開拓研究所主任研究員
篠原　真毅	京都大学生存圏研究所教授
田代　　信	埼玉大学理工学研究科／戦略研究センター教授
中村　智樹	東北大学大学院理学研究科教授
姫野　武洋	東京大学大学院工学系研究科航空宇宙工学専攻教授
外本　伸治	九州大学大学院工学研究院教授
渡辺　圭子	立命館大学理工学部機械工学科教授

宇宙科学研究所

稲富　裕光	学際科学研究系研究主幹
齋藤　義文	太陽系科学研究系研究主幹
坂井　真一郎	宇宙機応用工学研究系研究主幹
澤井　秀次郎	宇宙飛翔工学研究系教授（副所長）
田中　　智	太陽系科学研究系教授
津田　雄一	宇宙飛翔工学研究系教授（副所長）
野中　　聡	宇宙飛翔工学研究系研究主幹
船木　一幸	宇宙飛翔工学研究系教授（国際調整主幹）
水野　貴秀	宇宙機応用工学研究系教授／大学共同利用実験調整グループ長
山﨑　典子	宇宙物理学研究系研究主幹
吉田　哲也	学際科学研究系教授（研究総主幹）

任期は2025年4月1日～2027年3月31日