JAXA の中期計画において、「大学共同利用システムを基本とする宇宙科学研究においては、有識者による評価をその後の事業に十分に反映させる」と定めています。
これを踏まえ、宇宙科学研究所の学術研究とそれに関連する活動について、宇宙理学と宇宙工学の長期的な視野にたって評価することを目的として、5年に一度を目途に、宇宙科学研究所の外部評価委員会を開催し、外部評価を実施しています。

なお、外部評価とは別に、JAXA は、独立行政法人通則法に基づき、毎年政府による評価も受けています。