JAXA は、日本政府内に設置された独立行政法人評価委員会により毎年、さらに、中期計画期間後に評価を受けています。 JAXA の中期計画では、 「宇宙科学研究所 の学術研究については中期計画期間中に一度、外部評価委員会による評価を受ける」、と定めています。

この規定に基づき、宇宙科学研究所の学術研究とそれに関連する活動について、宇宙理学と宇宙工学の長期的な視野にたって評価するために、 所長により宇宙科学研究本部の外部評価 委員会のメンバーが招集され、評価が行われています。